Citation de Incirconcis
Merci c'est concis et clair.
Mais je reste quand même sur ma faim concernant la spéciation chez les bactéries. A quel moment, sur quels critères, on peut affirmer "ça c'est une mutation fondamentale, on change d'espèce". Les vulgarisations que j'ai trouvé sur le sujet restent trop en superficie.

On façon d'aborder le problème c'est de considérer que deux espèces de bactéries sont différentes lorsque le transfert d'information génétique entre elles devient impossible. Mais ce n'est pas clairement délimité et il y a de nombreuse exception.

La nature se fiche pas mal des définitions de la biologie. On fait comme on peut avec la nomenclature a notre disposition. C'est limite plus un problème de communication

Cet article https://www.ncbi.nlm.nih.[...]/pmc/articles/PMC2220085/

préfère parler de groupes (clusters) qui se recombinent plus ou moins bien inter- et intra-groupes. À partir d'un certain seuil leurs chemins se séparent (différents habitats) et on peut parler de spéciation, mais la ligne peut rester floue. Ça fait des bactérie un modèles intéressant pour étudier les intermédiaire de l'évolution.
La difficulté c'est que l'on comprend encore très mal les écosystèmes bactériens, et donc les pressions évolutives qui s'y exercent.