L'incidence des fentes labiales et palatines semble varier selon les populations. L'incidence est plus élevée dans les populations japonaises (1 sur 584) et plus basse dans les populations noires américaines (1 sur 2 273) que dans la population d'origine européenne, où elle est proche de 1 sur 1 000.
Cette pathologie est deux fois plus fréquente chez les filles que chez les garçons.

La cigarette ou l'alcool ont été mis en cause dans la genèse des fentes labiales